183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2948 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  100 
 
 
383 aa  725    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  99.74 
 
 
383 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  99.73 
 
 
377 aa  710    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  99.73 
 
 
377 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  99.2 
 
 
377 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  99.47 
 
 
377 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  99.73 
 
 
377 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  93.1 
 
 
377 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  71.86 
 
 
376 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  71.2 
 
 
376 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  71.2 
 
 
378 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  71.31 
 
 
377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  71.47 
 
 
376 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  71.47 
 
 
376 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  71.58 
 
 
377 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  67.67 
 
 
382 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  50.31 
 
 
408 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  49.53 
 
 
385 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  49.53 
 
 
385 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  45.59 
 
 
369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  42.2 
 
 
370 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  44.17 
 
 
366 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  41.77 
 
 
370 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  41.16 
 
 
370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  41.16 
 
 
370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  41.16 
 
 
370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  40.8 
 
 
372 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  40.67 
 
 
372 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  40.67 
 
 
372 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  40.67 
 
 
372 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  40.67 
 
 
372 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  40.37 
 
 
372 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  40.37 
 
 
372 aa  229  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  40.37 
 
 
372 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  40.67 
 
 
372 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  47.34 
 
 
378 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  41.02 
 
 
367 aa  179  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  30.09 
 
 
383 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  30.09 
 
 
383 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  30.57 
 
 
383 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  30.72 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  30.72 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  29.4 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  28.57 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  33.44 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  30.43 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  30.14 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  30.62 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  34.7 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.49 
 
 
419 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  31.44 
 
 
405 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  28.43 
 
 
377 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  26.47 
 
 
398 aa  103  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  28.29 
 
 
366 aa  103  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  25.77 
 
 
395 aa  102  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  28.84 
 
 
368 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  31.37 
 
 
402 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  33.74 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  32.83 
 
 
413 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  27.73 
 
 
392 aa  96.3  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.37 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  27.66 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  33.13 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  30.37 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.57 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.81 
 
 
419 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  32.7 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.1 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  26.99 
 
 
400 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  25.25 
 
 
440 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.55 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  31 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  30.49 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.4 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  26.86 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  24.65 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  29.57 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  37.88 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  29.97 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  29.37 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  25 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  28.88 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  29.02 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  25.69 
 
 
414 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  23.99 
 
 
422 aa  77  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  31.12 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  23.4 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  22.71 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  24.93 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  23.95 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  21.98 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  23.34 
 
 
424 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  28.8 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  23.4 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.43 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  29.47 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.83 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  26.67 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  23.75 
 
 
431 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  26.2 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>