More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1987 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  84.54 
 
 		 427 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  100 
 
 		 427 aa  838    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  68.01 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  64.76 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  60.63 
 
 		 423 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  63.53 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  61.52 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  56.81 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  55.89 
 
 		 440 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  54.76 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  54.76 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  55.45 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  55.45 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  55.45 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  55.45 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  53.83 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  55.68 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  55.45 
 
 		 444 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  55.45 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  55.68 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  55.68 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  55.45 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  54.76 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  54.76 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  55.45 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  54.29 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  54.29 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  53.83 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  54.29 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  54.29 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  50.84 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  53.83 
 
 		 441 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  49.64 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  50.58 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  51.21 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  48.38 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  48.93 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  46.96 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  48.57 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  50.12 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  46.19 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  44.83 
 
 		 417 aa  345  8e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  43.87 
 
 		 428 aa  335  9e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  42.79 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  43.87 
 
 		 415 aa  332  5e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  48 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  42.58 
 
 		 425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  43.57 
 
 		 425 aa  329  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  44.93 
 
 		 577 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  40.8 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  40.8 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  40.89 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  42.47 
 
 		 451 aa  315  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  41.86 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  43.06 
 
 		 428 aa  306  6e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  40.67 
 
 		 967 aa  284  3.0000000000000004e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  41.01 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  40.35 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  35.95 
 
 		 429 aa  270  5e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  39.09 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  40.41 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  39.22 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  38.59 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  38.59 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  33.33 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  32.93 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  29.71 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  29.71 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  28.76 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  32.26 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  30.22 
 
 		 419 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  31.96 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  31.76 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  28.57 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  28.7 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  28.93 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  30.14 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.71 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  28.5 
 
 		 409 aa  152  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  29.38 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  28.28 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  29.52 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  28.06 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.59 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  27.6 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  28.5 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.11 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  29.57 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  31.07 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  29.18 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  30.9 
 
 		 429 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  32.26 
 
 		 413 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  29.46 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  31.56 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  28.57 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  27.78 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  29.5 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.5 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  27.57 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.91 
 
 		 426 aa  116  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>