More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4948 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  74.89 
 
 
444 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  100 
 
 
445 aa  862    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  74.89 
 
 
444 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  73.93 
 
 
447 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  73.48 
 
 
445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  46.33 
 
 
447 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  48.52 
 
 
434 aa  330  4e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  39.68 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  33.11 
 
 
421 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  31.32 
 
 
422 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  32.07 
 
 
424 aa  203  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  31.51 
 
 
424 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  32 
 
 
441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  30.16 
 
 
423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  32.22 
 
 
441 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  30.67 
 
 
427 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  32.45 
 
 
440 aa  187  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  30.77 
 
 
419 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  32 
 
 
441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  31.44 
 
 
440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  30.89 
 
 
427 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  32.22 
 
 
441 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  32 
 
 
441 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  31.4 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  32 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  32.07 
 
 
441 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  32.07 
 
 
441 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  32.07 
 
 
441 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  32.07 
 
 
441 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  30.98 
 
 
427 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  31.13 
 
 
441 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  31.35 
 
 
441 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  29.53 
 
 
429 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  31.13 
 
 
444 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  31.35 
 
 
444 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  31.35 
 
 
444 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  31.13 
 
 
441 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  31.49 
 
 
444 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  31.49 
 
 
444 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  31.57 
 
 
444 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  30.82 
 
 
441 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.73 
 
 
440 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  31.53 
 
 
431 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  31.35 
 
 
441 aa  176  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  30.7 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  29.98 
 
 
428 aa  173  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  31.46 
 
 
428 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  32.59 
 
 
431 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  28.67 
 
 
427 aa  169  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  30.32 
 
 
415 aa  169  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  30.12 
 
 
437 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  30.12 
 
 
437 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  31.55 
 
 
422 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  28.6 
 
 
425 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  31.01 
 
 
424 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  28.03 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  29.07 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  27.54 
 
 
429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  29.16 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  29.02 
 
 
428 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  29.73 
 
 
423 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  29.65 
 
 
437 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  30.19 
 
 
967 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  28.32 
 
 
577 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  31.43 
 
 
431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  29.22 
 
 
429 aa  154  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  27.38 
 
 
417 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  27.76 
 
 
422 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  26.6 
 
 
408 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  25.74 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  26.65 
 
 
424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  27.88 
 
 
421 aa  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  25.62 
 
 
422 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  27.66 
 
 
421 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  23.4 
 
 
430 aa  107  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  25.12 
 
 
428 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  24.94 
 
 
405 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  21.4 
 
 
429 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  26.15 
 
 
408 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  22.01 
 
 
430 aa  96.7  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  22.01 
 
 
430 aa  96.7  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  24.53 
 
 
405 aa  96.3  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  24.32 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  22.6 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  25.06 
 
 
465 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  22.06 
 
 
430 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  21.58 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25.29 
 
 
402 aa  90.5  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  25.94 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  24.53 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  22.95 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  27 
 
 
418 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  26.06 
 
 
424 aa  87  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  21.89 
 
 
432 aa  86.7  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  22.42 
 
 
427 aa  87  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  28.03 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  27.54 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  25.58 
 
 
384 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  26.77 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  24.37 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>