More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3015 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  73.64 
 
 
441 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  100 
 
 
440 aa  872    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  74.55 
 
 
441 aa  658    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  74.09 
 
 
441 aa  637    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  74.32 
 
 
441 aa  638    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  74.55 
 
 
441 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  74.09 
 
 
451 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  73.86 
 
 
441 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  74.55 
 
 
441 aa  631  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  73.41 
 
 
441 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  74.32 
 
 
444 aa  628  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  74.55 
 
 
444 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  74.55 
 
 
444 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  74.32 
 
 
441 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  73.41 
 
 
441 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  74.77 
 
 
441 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  74.55 
 
 
444 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  73.41 
 
 
441 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  75.87 
 
 
444 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  73.41 
 
 
441 aa  622  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  73.41 
 
 
441 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  75.87 
 
 
444 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  73.41 
 
 
441 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  57.04 
 
 
427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  55.89 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  54.31 
 
 
424 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  52.94 
 
 
423 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  53.01 
 
 
431 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  52.91 
 
 
427 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  50.7 
 
 
423 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  53.77 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  46.82 
 
 
419 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  47.75 
 
 
421 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  44.24 
 
 
440 aa  365  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  44.13 
 
 
422 aa  362  7.0000000000000005e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  46.62 
 
 
426 aa  362  8e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  43.88 
 
 
451 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  44.76 
 
 
431 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  44.29 
 
 
440 aa  349  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  45.07 
 
 
427 aa  345  8.999999999999999e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  42.75 
 
 
424 aa  342  8e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  42.29 
 
 
437 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  42.29 
 
 
437 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  42.06 
 
 
437 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  42.39 
 
 
429 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  43.82 
 
 
428 aa  328  9e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  47.3 
 
 
422 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  41.03 
 
 
428 aa  323  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  43.46 
 
 
425 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  41.92 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  42.86 
 
 
428 aa  320  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  43.62 
 
 
431 aa  316  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  42.69 
 
 
415 aa  316  6e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  43 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  39.36 
 
 
967 aa  296  5e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  38.8 
 
 
429 aa  269  8e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  38.18 
 
 
577 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  38.41 
 
 
447 aa  262  8e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  38.84 
 
 
422 aa  247  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  35.6 
 
 
429 aa  239  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  33.25 
 
 
429 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  36.2 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  33.18 
 
 
421 aa  200  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  31.19 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  31.65 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  30.7 
 
 
445 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  31.25 
 
 
422 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  30.26 
 
 
421 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  30.29 
 
 
445 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  30.33 
 
 
444 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  30.33 
 
 
444 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  34.5 
 
 
419 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  30.54 
 
 
428 aa  169  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  29.2 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  29.56 
 
 
405 aa  159  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  28.83 
 
 
446 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  30.81 
 
 
401 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  30.07 
 
 
400 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  31.28 
 
 
405 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  31.08 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.28 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  31.94 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  29.57 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  27.91 
 
 
447 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  27.38 
 
 
405 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  30.24 
 
 
396 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  24.66 
 
 
465 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.32 
 
 
404 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  28.37 
 
 
414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  25.9 
 
 
409 aa  119  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  28.06 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.42 
 
 
436 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  30.54 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  29.88 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  24.46 
 
 
419 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  27.08 
 
 
402 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  22.17 
 
 
426 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  28.5 
 
 
414 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  28.99 
 
 
429 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  25.23 
 
 
449 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>