254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2052 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  100 
 
 
447 aa  867    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  58.37 
 
 
446 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  43.93 
 
 
444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  43.93 
 
 
444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  44.77 
 
 
445 aa  335  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  45.2 
 
 
445 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  45.34 
 
 
447 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  41.2 
 
 
434 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  32.05 
 
 
429 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  29.72 
 
 
419 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  31.07 
 
 
421 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  32.09 
 
 
440 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  32.72 
 
 
428 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  32.11 
 
 
437 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  31.28 
 
 
437 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  31.28 
 
 
437 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  29.43 
 
 
441 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  28.79 
 
 
447 aa  144  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  29.43 
 
 
441 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  31.27 
 
 
422 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  32.38 
 
 
428 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  27.31 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  29.13 
 
 
425 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  27.54 
 
 
422 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  29.02 
 
 
441 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  29.32 
 
 
451 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  33.94 
 
 
431 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  30.82 
 
 
428 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  25.81 
 
 
429 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  30.14 
 
 
441 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  29.38 
 
 
431 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  29.02 
 
 
441 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  27.52 
 
 
423 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  29.9 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  30.07 
 
 
441 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  28.74 
 
 
425 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  29.05 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  28.21 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  25.74 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  29.28 
 
 
444 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  26.68 
 
 
424 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  29.05 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  28.74 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  28.84 
 
 
441 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  29.67 
 
 
451 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  28.95 
 
 
441 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  28.95 
 
 
441 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  28.95 
 
 
441 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  28.95 
 
 
441 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  28.83 
 
 
441 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  28.83 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  28.83 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  28.15 
 
 
441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  28.83 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  28.83 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.42 
 
 
427 aa  131  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  27.44 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  27.87 
 
 
429 aa  127  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  27.27 
 
 
427 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  27.29 
 
 
429 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  28.54 
 
 
440 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  28.34 
 
 
415 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  26.98 
 
 
967 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  28.85 
 
 
431 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  28.99 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  28.41 
 
 
577 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  23.21 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  27.99 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  29.76 
 
 
428 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  25.13 
 
 
424 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  24.1 
 
 
408 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  26.08 
 
 
421 aa  97.1  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  26.51 
 
 
400 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  28.6 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  25.69 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  25.81 
 
 
421 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  25.07 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  27.83 
 
 
419 aa  87  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  24.94 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  25.07 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  24.8 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  25.8 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  23.86 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  23.9 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  29.49 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  26.11 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  26.01 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  26.62 
 
 
417 aa  77  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  22.68 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  26.93 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  23.46 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  22.79 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  25.48 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  26.54 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  22.8 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  25.35 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  26.61 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  20.59 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  22.71 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  27.95 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>