More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1546 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  100 
 
 
429 aa  840    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  61.31 
 
 
429 aa  542  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  49.49 
 
 
408 aa  395  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  43.69 
 
 
425 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  44.84 
 
 
425 aa  368  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  41.61 
 
 
423 aa  312  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  39.29 
 
 
421 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  43.28 
 
 
422 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  39.63 
 
 
422 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  39.05 
 
 
419 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  40.97 
 
 
424 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  41.08 
 
 
431 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  38.61 
 
 
427 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  39.48 
 
 
427 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  38.44 
 
 
424 aa  275  8e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  36.81 
 
 
431 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  36.72 
 
 
426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  34.95 
 
 
440 aa  266  5e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  35.75 
 
 
427 aa  263  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  38.17 
 
 
423 aa  260  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  37.96 
 
 
417 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  38.9 
 
 
427 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  35.03 
 
 
415 aa  252  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  37.7 
 
 
441 aa  251  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  37.53 
 
 
424 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  33.49 
 
 
437 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  35.6 
 
 
440 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  33.49 
 
 
437 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  33.49 
 
 
437 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  35.51 
 
 
441 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  37.47 
 
 
441 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  37.47 
 
 
441 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  33.64 
 
 
429 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  33.41 
 
 
451 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  37.94 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  35.05 
 
 
441 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  37.7 
 
 
441 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  37.47 
 
 
444 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  37.47 
 
 
444 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  37.7 
 
 
444 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  37.7 
 
 
444 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  34.32 
 
 
440 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  37.7 
 
 
444 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  37.7 
 
 
444 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  33.95 
 
 
428 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  33.26 
 
 
428 aa  236  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  35.28 
 
 
441 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  35.05 
 
 
441 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  36.46 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  35.05 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  36.21 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  36.21 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  36.28 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  36.21 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  36.21 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  34.58 
 
 
451 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  32.11 
 
 
428 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  34.63 
 
 
431 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  34.57 
 
 
429 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  31.19 
 
 
577 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  33.78 
 
 
967 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  32.33 
 
 
421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  30.9 
 
 
421 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  30.48 
 
 
424 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  31.76 
 
 
447 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  31.41 
 
 
421 aa  176  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  30.89 
 
 
409 aa  157  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  25.74 
 
 
445 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  25.33 
 
 
444 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  25.33 
 
 
444 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.91 
 
 
400 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  28.5 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  26.74 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  26.97 
 
 
405 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  26 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  25.54 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  24.2 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  26.06 
 
 
428 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.87 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  28.17 
 
 
436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  27.53 
 
 
401 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  25.12 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  25.06 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  26.53 
 
 
411 aa  114  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  24.43 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  26.7 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  28.81 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  24.83 
 
 
429 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  25.74 
 
 
404 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  25.24 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  23.88 
 
 
404 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  26.3 
 
 
421 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  25.73 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  24.83 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25.19 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  25.11 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  25.11 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  25.11 
 
 
422 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  24.26 
 
 
422 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>