201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1423 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  100 
 
 
404 aa  785    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  74.88 
 
 
421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  67.74 
 
 
433 aa  534  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  68.24 
 
 
420 aa  521  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  57.53 
 
 
452 aa  437  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  45.65 
 
 
436 aa  349  6e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  38.25 
 
 
417 aa  216  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  37.15 
 
 
414 aa  212  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  35.95 
 
 
422 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  36.5 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  35.81 
 
 
397 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  33.33 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  34.41 
 
 
413 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  34.41 
 
 
413 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  33.5 
 
 
405 aa  186  8e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  37.13 
 
 
417 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  36.76 
 
 
384 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  33.98 
 
 
414 aa  169  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  32.91 
 
 
410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  31.52 
 
 
400 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  37.5 
 
 
418 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.75 
 
 
419 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  30.02 
 
 
428 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  29.84 
 
 
429 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  27.74 
 
 
440 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  29.3 
 
 
405 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  29.92 
 
 
422 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  28.13 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  30.1 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  32.98 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  33.44 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  30.63 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  28.57 
 
 
427 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  27.82 
 
 
431 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.68 
 
 
431 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  28.33 
 
 
423 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  28.34 
 
 
402 aa  103  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  29.74 
 
 
465 aa  103  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  28.49 
 
 
423 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  26.11 
 
 
425 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  27.25 
 
 
424 aa  96.7  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  30.87 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  25.6 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  27.85 
 
 
425 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  26.8 
 
 
451 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.75 
 
 
426 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  27.37 
 
 
427 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  26.21 
 
 
417 aa  92.8  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  26.5 
 
 
385 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  26.5 
 
 
385 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  26.84 
 
 
429 aa  91.3  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  29.29 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.37 
 
 
408 aa  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  26.54 
 
 
440 aa  89.7  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.13 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.13 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  26.59 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  25.93 
 
 
424 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  26.47 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  29.65 
 
 
396 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.85 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  29.55 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.27 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.59 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  25.86 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  25.74 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  26.81 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  25 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.28 
 
 
426 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  26.67 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  24.1 
 
 
577 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  25.46 
 
 
427 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  26.7 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  25.32 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  25.78 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  25.98 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  24.48 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  24.48 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  22.95 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  23.67 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  24.93 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  26.16 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  24.94 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  24.69 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  23.67 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  27.35 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  25.48 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  23.67 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  24.1 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  24.3 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  22.14 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  26.44 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  23.67 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  23.48 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  24.16 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  27.07 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  26.89 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  24.82 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  23.45 
 
 
447 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  27.43 
 
 
446 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>