More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3289 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  100 
 
 
444 aa  863    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  100 
 
 
444 aa  863    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  74.89 
 
 
445 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  71.88 
 
 
447 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  74.21 
 
 
445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  45.2 
 
 
447 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  46.12 
 
 
434 aa  326  6e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  39.72 
 
 
446 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  31.47 
 
 
422 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  31.56 
 
 
424 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  33.56 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  32.14 
 
 
427 aa  197  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  31.32 
 
 
424 aa  193  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.93 
 
 
440 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  32.23 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  28.92 
 
 
423 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  29.98 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  30.16 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  31.57 
 
 
431 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  30.62 
 
 
440 aa  176  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  30.33 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  31.89 
 
 
427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  28.19 
 
 
427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  31.51 
 
 
419 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  29.64 
 
 
425 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  31.87 
 
 
431 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  31.25 
 
 
441 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  30.2 
 
 
415 aa  169  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  31.25 
 
 
441 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  31.14 
 
 
441 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  31.14 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  31.14 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  28.73 
 
 
451 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  30.67 
 
 
441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  31.14 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  30.92 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  31.14 
 
 
441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  30.92 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  31.14 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  30.67 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  29.18 
 
 
425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  30.48 
 
 
441 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  34.6 
 
 
422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  31.71 
 
 
441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  31.48 
 
 
441 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  29.66 
 
 
429 aa  162  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  31.48 
 
 
441 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  31.25 
 
 
441 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  31 
 
 
441 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  31 
 
 
441 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  31 
 
 
441 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  30.1 
 
 
437 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  31 
 
 
441 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  30.1 
 
 
437 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  28.83 
 
 
428 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  31.64 
 
 
431 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  30.44 
 
 
451 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  30.63 
 
 
437 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  29.05 
 
 
967 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  29.71 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  30.42 
 
 
428 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  29.98 
 
 
424 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  26.86 
 
 
577 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  30.83 
 
 
428 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  27.63 
 
 
429 aa  150  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  27.85 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  28.94 
 
 
417 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  29.03 
 
 
422 aa  142  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  25.77 
 
 
429 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  25.18 
 
 
408 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  28.61 
 
 
421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  27.59 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  27.49 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  26.04 
 
 
422 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  26.14 
 
 
428 aa  109  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  26.9 
 
 
384 aa  97.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  25.91 
 
 
465 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  25.56 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  23.8 
 
 
429 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  23.53 
 
 
430 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  22.42 
 
 
430 aa  89.7  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  25.39 
 
 
408 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  25.07 
 
 
404 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  23.54 
 
 
411 aa  87.4  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  22.57 
 
 
429 aa  87  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  25.37 
 
 
417 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  24.32 
 
 
424 aa  87  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  23.6 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  22.22 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  22.22 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  23.38 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  23.46 
 
 
427 aa  84  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  22.22 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  27.14 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  25.19 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  23.38 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  23.38 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  23.38 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  23.38 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  23.38 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>