More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0015 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  100 
 
 
431 aa  850    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  65.89 
 
 
431 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  62.17 
 
 
451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  57.94 
 
 
428 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  56.6 
 
 
437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  56.6 
 
 
437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  56.37 
 
 
437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  56 
 
 
429 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  55.94 
 
 
428 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  55.53 
 
 
428 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  49.43 
 
 
440 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  48.93 
 
 
421 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  48.59 
 
 
424 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  46.59 
 
 
423 aa  362  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  47.52 
 
 
431 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  45.39 
 
 
419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  46.71 
 
 
423 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  45.52 
 
 
424 aa  341  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  44.11 
 
 
426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  47.89 
 
 
427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  42.92 
 
 
441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  42.92 
 
 
441 aa  335  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  43.85 
 
 
451 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  46.59 
 
 
427 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  42.26 
 
 
440 aa  331  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  42.92 
 
 
441 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  43.22 
 
 
440 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  43.16 
 
 
441 aa  322  8e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  43.16 
 
 
441 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  42.46 
 
 
441 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  42.92 
 
 
441 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  43.16 
 
 
441 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  43.16 
 
 
441 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  42.92 
 
 
441 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  43.16 
 
 
441 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  43.16 
 
 
441 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  43.26 
 
 
422 aa  318  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  43.16 
 
 
441 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  44.92 
 
 
427 aa  317  4e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  42.69 
 
 
441 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  42.69 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  42.69 
 
 
441 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  42.69 
 
 
444 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  42.69 
 
 
444 aa  312  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  42.69 
 
 
444 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  42.69 
 
 
444 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  42.46 
 
 
444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  43.03 
 
 
415 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  42.48 
 
 
417 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  41.8 
 
 
427 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  44.89 
 
 
424 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  43.52 
 
 
422 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  42.2 
 
 
577 aa  294  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  39.72 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  38.39 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  40.05 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  39.64 
 
 
967 aa  252  9.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  36.19 
 
 
429 aa  246  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  36.6 
 
 
447 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  35.78 
 
 
429 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  33.95 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  32.99 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  34.35 
 
 
421 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  35.66 
 
 
421 aa  202  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  32.68 
 
 
421 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  32.51 
 
 
424 aa  179  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  32.01 
 
 
444 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  32.01 
 
 
444 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  31.28 
 
 
445 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  30.52 
 
 
428 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  30.96 
 
 
446 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  28.54 
 
 
422 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  30.98 
 
 
408 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  32.14 
 
 
445 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  31.25 
 
 
465 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  30.67 
 
 
447 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  33.11 
 
 
447 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  26.37 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  31.36 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  27.83 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  28.72 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  31.84 
 
 
414 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  27.3 
 
 
419 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  33.99 
 
 
413 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  30.27 
 
 
405 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  30.18 
 
 
434 aa  123  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  33.12 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  34.13 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.69 
 
 
404 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.32 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  34.13 
 
 
429 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  26.91 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  27.82 
 
 
404 aa  113  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  29.31 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  26.17 
 
 
405 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  28.06 
 
 
410 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  23.79 
 
 
436 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25.64 
 
 
402 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  29.53 
 
 
426 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  29.53 
 
 
404 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>