More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0796 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  100 
 
 		 424 aa  820    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  52.77 
 
 		 421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  52.53 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  52.31 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  35.51 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  34.5 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  34.56 
 
 		 423 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  33.5 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  30.5 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  30.86 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  32.07 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  32.16 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  31.53 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  31.53 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  33.82 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  33.11 
 
 		 427 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  32.88 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  32.93 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  33.58 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  32.41 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  34.13 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  33.25 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  32.14 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  32.86 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  33.66 
 
 		 431 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  32.2 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  29.03 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  28.81 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  32.29 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.93 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  33.87 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  34.26 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  29.78 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  31.65 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  33.82 
 
 		 441 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  33.82 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  29.95 
 
 		 415 aa  169  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  33.82 
 
 		 441 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  33.25 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  33.33 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  31.86 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  31.86 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  31.14 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  33.09 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  33.09 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  33.09 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  33.09 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  31.86 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  31.86 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  31.59 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  31.86 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  31.21 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  32.12 
 
 		 431 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  31.12 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  31.63 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  31.44 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  31.63 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  31.63 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  33.41 
 
 		 422 aa  159  9e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  30.64 
 
 		 441 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  31.51 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  32.43 
 
 		 577 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.76 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  29.29 
 
 		 967 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25.53 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  30.6 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  28.46 
 
 		 447 aa  129  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26.34 
 
 		 465 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.33 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  27.49 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  27.49 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  25.78 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  26.8 
 
 		 445 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  24.26 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  26.51 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  26.89 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  26.28 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  25.71 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  24.94 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  23.75 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  25.53 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  25.82 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  25.95 
 
 		 405 aa  93.2  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  25.12 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  24.88 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  26.84 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  23.75 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  25.95 
 
 		 396 aa  88.2  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  23.5 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  25.23 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25.34 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  26.78 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  24.57 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  25.2 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  24.71 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  26.43 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  25 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  25.69 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  26.65 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  23.91 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>