More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1347 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  100 
 
 
414 aa  818    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  55.64 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  50.6 
 
 
414 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  50.5 
 
 
417 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  50.37 
 
 
413 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  50.64 
 
 
397 aa  352  5e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  45.82 
 
 
413 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  45.57 
 
 
413 aa  339  5.9999999999999996e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  45.83 
 
 
410 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  43.93 
 
 
384 aa  279  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  36.06 
 
 
411 aa  225  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  37.5 
 
 
436 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  37.02 
 
 
405 aa  224  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  36.02 
 
 
417 aa  222  7e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  35.86 
 
 
421 aa  210  3e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  37.56 
 
 
404 aa  209  7e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  35.93 
 
 
433 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  36.91 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  34.74 
 
 
452 aa  193  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  32.2 
 
 
405 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  31.41 
 
 
400 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  31.32 
 
 
414 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  31.84 
 
 
405 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  32.45 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  32.19 
 
 
401 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  30.12 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.89 
 
 
419 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  30.51 
 
 
421 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  29.67 
 
 
423 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  26.25 
 
 
419 aa  124  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.72 
 
 
408 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  29.65 
 
 
404 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  31.78 
 
 
418 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  31.12 
 
 
396 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  28.21 
 
 
429 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  25.13 
 
 
427 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  29.97 
 
 
426 aa  116  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  26.1 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  29.41 
 
 
423 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  31.43 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  30.25 
 
 
429 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  27.91 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  26.74 
 
 
424 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  29.97 
 
 
429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  27.34 
 
 
440 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  27.06 
 
 
427 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.7 
 
 
431 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  29.86 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  26.47 
 
 
426 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  28.42 
 
 
424 aa  109  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.97 
 
 
428 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  24.69 
 
 
427 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.25 
 
 
422 aa  106  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  26.88 
 
 
422 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  28.38 
 
 
424 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  28.05 
 
 
427 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  26.42 
 
 
437 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  26.42 
 
 
437 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  26.42 
 
 
437 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  26.58 
 
 
413 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  28.98 
 
 
415 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  27.76 
 
 
431 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  27.35 
 
 
417 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  28.5 
 
 
440 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  29.34 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  29.34 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  29.34 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  29.34 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  29.02 
 
 
441 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  27.47 
 
 
441 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  26.37 
 
 
451 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  28.3 
 
 
441 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  28.08 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  28.14 
 
 
417 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  25.45 
 
 
417 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  27.67 
 
 
441 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.02 
 
 
431 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  27.76 
 
 
441 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  27.35 
 
 
424 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  25.54 
 
 
447 aa  93.6  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  26.61 
 
 
451 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  27.51 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.62 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  24.87 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.61 
 
 
429 aa  90.5  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  26.62 
 
 
577 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  26.3 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  29.17 
 
 
448 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  24.8 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  26.55 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  27.39 
 
 
449 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26.06 
 
 
465 aa  87.4  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  27.4 
 
 
421 aa  86.7  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  24.51 
 
 
416 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  22.22 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  26.05 
 
 
444 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  26.05 
 
 
444 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  25.56 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  24.94 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  26.56 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>