176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1181 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  100 
 
 
420 aa  816    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  95.24 
 
 
433 aa  753    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  71.22 
 
 
421 aa  553  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  68.24 
 
 
404 aa  538  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  54 
 
 
452 aa  418  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  44.74 
 
 
436 aa  352  8e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  36.91 
 
 
414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  35.95 
 
 
422 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  38.12 
 
 
417 aa  197  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  34.7 
 
 
413 aa  196  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  33.33 
 
 
413 aa  189  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  32.83 
 
 
413 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  33.41 
 
 
411 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  32.23 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  35.71 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  35.52 
 
 
417 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  33.87 
 
 
384 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  33.57 
 
 
414 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  31.73 
 
 
410 aa  167  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  28.89 
 
 
405 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.07 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  30.27 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.7 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  35.22 
 
 
418 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.95 
 
 
419 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  30.24 
 
 
405 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  30.72 
 
 
404 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  28.01 
 
 
429 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  26.6 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  27.15 
 
 
428 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  30 
 
 
404 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  30.79 
 
 
396 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  26.74 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  26.74 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.62 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  26.42 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.8 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  25.06 
 
 
424 aa  87.4  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  26.16 
 
 
427 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.27 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  24.15 
 
 
440 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26.98 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  25.59 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  25.85 
 
 
421 aa  84  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  25.46 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  26.39 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.93 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  25.14 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  25.74 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  25 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  27.32 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  30.41 
 
 
421 aa  77  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  25.49 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  25.7 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  23.64 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  24.73 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  34.18 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  24.47 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.53 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  22.93 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  23.54 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.13 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  24.31 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  23.35 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  23.35 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  23.73 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  25.4 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  23.75 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  22.19 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  27.01 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  26.5 
 
 
378 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  25.07 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  25.5 
 
 
366 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  24.87 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  23.06 
 
 
369 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  35.07 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  23.98 
 
 
428 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  25.46 
 
 
577 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  21.48 
 
 
451 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  21.72 
 
 
429 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1816  arsenite transport protein  57.14 
 
 
63 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  25.61 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  21.67 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  31.76 
 
 
447 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  29.41 
 
 
446 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  22.68 
 
 
441 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  31.85 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  24.93 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  23.17 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  24.01 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  24.01 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  23.93 
 
 
441 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  26.22 
 
 
377 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  25.67 
 
 
376 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  24.46 
 
 
383 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  22.16 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  24.01 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  25.06 
 
 
428 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  24.8 
 
 
377 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>