114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2206 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 427 aa  848    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  66.59 
 
 		 428 aa  591  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  68.15 
 
 		 426 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  65.81 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  67.68 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  68.33 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  49.34 
 
 		 458 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  51.17 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  50.7 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  44.69 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  44.67 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  43.12 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  46.74 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  30.68 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  30.39 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  31.28 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  32.48 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  32.24 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  29.65 
 
 		 470 aa  156  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  30.79 
 
 		 452 aa  155  9e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  30.2 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  30.91 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 		 489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  31.12 
 
 		 449 aa  153  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  30.4 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  29.32 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  29.58 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 		 489 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 		 489 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  30.02 
 
 		 478 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  29.41 
 
 		 462 aa  149  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  31.56 
 
 		 488 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  30.13 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  29.37 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  29.01 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  30.13 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  30.13 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  30.13 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  29.91 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  30.51 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  29.22 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  30.32 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  31.05 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  29.69 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  28.98 
 
 		 492 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  28.6 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  28.88 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  31.41 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  28.7 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  28.18 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  29.08 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  27.11 
 
 		 493 aa  126  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  28.54 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  27.36 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  27.36 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  27.36 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  27.36 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  28.1 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  26.73 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  26.73 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  26.73 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  27.91 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  27.21 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  26.52 
 
 		 483 aa  114  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  28.06 
 
 		 465 aa  113  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  26.91 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  26.11 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  28.11 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  24.46 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  26.16 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  27.4 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  24.58 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  21.37 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.12 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  25.43 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.09 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  28.24 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  24.82 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.06 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  25.18 
 
 		 577 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  25.89 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.34 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.34 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  32.56 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.1 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  25.59 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  25.45 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.11 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  22.35 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  24.44 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  24.6 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  24.2 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  27.33 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  25.37 
 
 		 447 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  24.24 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  25.13 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  27.27 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  22.08 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>