119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0939 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  70.28 
 
 		 449 aa  639    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  100 
 
 		 462 aa  920    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  86.58 
 
 		 462 aa  815    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  66.16 
 
 		 457 aa  594  1e-169  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  66.96 
 
 		 452 aa  585  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  65.68 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  45.13 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  46.97 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  44.49 
 
 		 467 aa  359  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  44.85 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  41.89 
 
 		 489 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  41.74 
 
 		 478 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  41.45 
 
 		 476 aa  349  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  41.67 
 
 		 489 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  41.89 
 
 		 489 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  40.98 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  44.34 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  44.88 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  44.88 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  41.31 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  42.07 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  39.62 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  39.62 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  39.62 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  39.62 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  40.31 
 
 		 491 aa  333  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  42.74 
 
 		 488 aa  332  6e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  41.67 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  40.17 
 
 		 477 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  41.69 
 
 		 476 aa  322  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  40.53 
 
 		 492 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  39.96 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  40.68 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  40.72 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  40.7 
 
 		 465 aa  262  8.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  35.16 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  34.1 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  30.91 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  31.9 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  31.86 
 
 		 458 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  29.98 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  31.49 
 
 		 456 aa  170  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  32.01 
 
 		 417 aa  169  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  30.9 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  30.71 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  31.76 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  28.54 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  29.32 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  31.46 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  29.95 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  29.27 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  29.17 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  29.59 
 
 		 415 aa  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  30.28 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  30.28 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  30.28 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  30.58 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  29.59 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  29.59 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  29.59 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  29.59 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  30.24 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  29.28 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  28.86 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  27.84 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  26.35 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.72 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.28 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  23.99 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.89 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.89 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  24.28 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  24.84 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  26.16 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.25 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  23.8 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  29.37 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  27.58 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  25.47 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.78 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25.83 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  27.06 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  28.01 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.94 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  27.85 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  27.21 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  28.48 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  27.89 
 
 		 194 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  28.09 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  23.21 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  27.15 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  28.67 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  22.91 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  23.34 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  26.33 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.95 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.64 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>