138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2792 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  100 
 
 		 414 aa  808    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  55.42 
 
 		 417 aa  421  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  54.02 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  55.67 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  55.81 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  56.07 
 
 		 436 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  54.22 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  56.07 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  54.68 
 
 		 415 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  54.68 
 
 		 415 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  53.81 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  54.68 
 
 		 415 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  55.3 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  54.68 
 
 		 415 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  55.04 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  55.47 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  56.88 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  32.92 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  33.92 
 
 		 450 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  32.75 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  31.49 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  30.75 
 
 		 475 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  30.9 
 
 		 462 aa  186  6e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  30.67 
 
 		 448 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  29.11 
 
 		 491 aa  183  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  30.41 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  30.48 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  28.37 
 
 		 478 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  28.77 
 
 		 490 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  51.06 
 
 		 194 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  31.81 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  27.84 
 
 		 489 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  28.31 
 
 		 489 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  29.34 
 
 		 480 aa  176  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  27.84 
 
 		 489 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  29.05 
 
 		 490 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  31.07 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  27.74 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  28.31 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  28.31 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  28.71 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  28.67 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  28.31 
 
 		 489 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  30.18 
 
 		 429 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  29.17 
 
 		 460 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  28.47 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  28.33 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  28.33 
 
 		 432 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  27.23 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  28.79 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  28.84 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  28.6 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  32.09 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  27.95 
 
 		 475 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  30.07 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  29.41 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  26.15 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  29.15 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  26.82 
 
 		 493 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  28.78 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  26.67 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  27.62 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  27.05 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  25.36 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  27.34 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  28.13 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  24.31 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  27 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.69 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  24.93 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  23.17 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  26.94 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  26.44 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  23.81 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.35 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.39 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  25.78 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2708  hypothetical protein  23.92 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  24.83 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  26.25 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  24.36 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  25.72 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3024  hypothetical protein  26.32 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  25.06 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  24.58 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  25.65 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  26.22 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  25.81 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.63 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  24.6 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  22.99 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  23.96 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  20.45 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  25.16 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  25.47 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  26.81 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  22.94 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  24.12 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  24.36 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>