128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0421 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  100 
 
 		 457 aa  908    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  68.72 
 
 		 449 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  65.5 
 
 		 462 aa  597  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  67.04 
 
 		 462 aa  590  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  64.4 
 
 		 450 aa  581  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  63 
 
 		 452 aa  548  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  46.4 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  50.11 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  46.77 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  44.52 
 
 		 491 aa  362  9e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  48.48 
 
 		 470 aa  358  8e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  42.32 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  43.27 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  42.7 
 
 		 489 aa  347  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  42.47 
 
 		 489 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  42.95 
 
 		 478 aa  346  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  42.47 
 
 		 489 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  43.39 
 
 		 490 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  41.67 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  41.09 
 
 		 477 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  41.57 
 
 		 489 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  42.98 
 
 		 492 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  41.57 
 
 		 489 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  41.57 
 
 		 489 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  44.87 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  41.57 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  43.53 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  45.08 
 
 		 460 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  42.61 
 
 		 475 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  45.9 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  42.01 
 
 		 476 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  45.67 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  41.99 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  39.56 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  37.42 
 
 		 483 aa  269  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  41.15 
 
 		 465 aa  266  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  35.37 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  31.75 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  30.75 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  31.31 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  33.41 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  30.34 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  32.71 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  33.83 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  32.91 
 
 		 417 aa  156  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  30.91 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  29.6 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  30.83 
 
 		 414 aa  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  33.17 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  33.83 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  32.66 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  32.24 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  31.57 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  32.23 
 
 		 401 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  33.25 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  32.99 
 
 		 436 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  32.99 
 
 		 436 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  32.74 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  32.74 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  32.74 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  32.74 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  32.14 
 
 		 415 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  30.84 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  30.63 
 
 		 427 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  27.13 
 
 		 427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.22 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  25.29 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.8 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  28.08 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  25.6 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  24.13 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  24.13 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  27 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  26.03 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  24.36 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  24.5 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  27.01 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  23.17 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  23.6 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  30.46 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  26.16 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  27.18 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  26.02 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  25.76 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  25.76 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  26.14 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  23.95 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  25.51 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  27 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  24.69 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  24.52 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.13 
 
 		 419 aa  53.9  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.36 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  25 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  26.67 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  26.34 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25.71 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  26.67 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>