120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1556 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  86.74 
 
 		 462 aa  788    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  919    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  68.98 
 
 		 449 aa  632  1e-180  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  65.5 
 
 		 457 aa  597  1e-169  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  69.62 
 
 		 452 aa  592  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  64.24 
 
 		 450 aa  559  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  45.35 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  47.19 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  45.39 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  42.46 
 
 		 491 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  42.57 
 
 		 489 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  42.35 
 
 		 489 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  41.91 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  42.13 
 
 		 489 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  42.34 
 
 		 480 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  42 
 
 		 478 aa  349  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  45.21 
 
 		 470 aa  348  9e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  44.12 
 
 		 460 aa  347  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  44.42 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  44.42 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  40.95 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  40.95 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  41.83 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  40.95 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  41.46 
 
 		 476 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  40.73 
 
 		 489 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  43.28 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  41.38 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  41.23 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  40.99 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  41.34 
 
 		 475 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  40.09 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  40.27 
 
 		 481 aa  319  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  40.27 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  40.97 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  33.77 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  33.94 
 
 		 430 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  31.29 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  32.05 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  31.38 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  31.33 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 427 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  30.54 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  33.83 
 
 		 417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  30.41 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  30.65 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  29.41 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  29.66 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  30.39 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  28.83 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  30.67 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  30.46 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  31.46 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  30.75 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  30.02 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  29.93 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  30.02 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  30.35 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  30.02 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  29.29 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  29.29 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  29.29 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  29.29 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  29.21 
 
 		 427 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  29.78 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  28.14 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  24.94 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.71 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.72 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.79 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  24.94 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  25 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.66 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  26.8 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  27.1 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.94 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.77 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.77 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  22.95 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.73 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  24.29 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.35 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  28.12 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  29.93 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  23.95 
 
 		 422 aa  57  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  24.13 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  23.08 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  23.39 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  25.07 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  27.76 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  22.8 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  27.81 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  24.31 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  27.48 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  24.78 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  26.8 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  26.8 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  27.12 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  26.8 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>