126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0683 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 427 aa  845    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  71.66 
 
 		 427 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  74.36 
 
 		 428 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  68.85 
 
 		 426 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  67.45 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  68.38 
 
 		 427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  53.93 
 
 		 458 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  52.91 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  55.32 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  45.85 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  47.51 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  42.5 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  43.88 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  30.8 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  34.02 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  32.8 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  33.87 
 
 		 432 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  31.69 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  31.2 
 
 		 460 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  31.47 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  30.63 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  30.7 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  31.93 
 
 		 457 aa  166  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  32.13 
 
 		 488 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  29.93 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  32 
 
 		 452 aa  162  7e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  29.22 
 
 		 470 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  29.91 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  32.56 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  29.95 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  29.8 
 
 		 475 aa  159  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  33.25 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  28.48 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  29.43 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  29.12 
 
 		 489 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  29.88 
 
 		 489 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  30.55 
 
 		 415 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  28.81 
 
 		 489 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  29.15 
 
 		 489 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  29.15 
 
 		 489 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  29.5 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  30.47 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  30.47 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  29.29 
 
 		 415 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  29.26 
 
 		 489 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  30.22 
 
 		 436 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  29.05 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  30.22 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  30.07 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  29.22 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  29.22 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  29.22 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  29.22 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  29.31 
 
 		 415 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  26.08 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  27.82 
 
 		 490 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  25.57 
 
 		 493 aa  136  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  29.09 
 
 		 415 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  28.4 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  27.42 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  30.98 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  26.34 
 
 		 483 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  27.13 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  26.52 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  27.23 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.3 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  25.55 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  26.67 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  28.18 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  26 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  26.96 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  26.58 
 
 		 425 aa  67  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  29.59 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  27.29 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.24 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.24 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  27.03 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.82 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  25.37 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.23 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  25.77 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.12 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.3 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  24.31 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  24.65 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  26.3 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  25.52 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  24.24 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  24.46 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  23.28 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  24.26 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  23.15 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.3 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  22.38 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  23.81 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  23.2 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>