149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1235 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  100 
 
 		 415 aa  826    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  84.56 
 
 		 415 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  81.36 
 
 		 415 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  94.93 
 
 		 436 aa  749    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  94.93 
 
 		 436 aa  747    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  79.76 
 
 		 415 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  100 
 
 		 415 aa  826    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  95.17 
 
 		 436 aa  749    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  83.57 
 
 		 415 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  100 
 
 		 415 aa  826    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  81.64 
 
 		 415 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  94.2 
 
 		 415 aa  744    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  100 
 
 		 415 aa  826    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  84.3 
 
 		 415 aa  694    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  60.35 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  55.2 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  54.68 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  88.14 
 
 		 194 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  31.91 
 
 		 475 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  30.75 
 
 		 467 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  32.23 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  30.12 
 
 		 490 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  29.28 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  30.56 
 
 		 448 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  28.44 
 
 		 476 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  31.78 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  29.36 
 
 		 489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.26 
 
 		 488 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  28.88 
 
 		 489 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  29.12 
 
 		 489 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  29.91 
 
 		 491 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  29.59 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  29.59 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  29.36 
 
 		 476 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  34.17 
 
 		 450 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  29.69 
 
 		 489 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  29.36 
 
 		 489 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  31.63 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  31.94 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  29.44 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  29.81 
 
 		 490 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  27.64 
 
 		 470 aa  166  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  28.08 
 
 		 476 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 		 492 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  28.94 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  27.51 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  29.43 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  32.74 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  29.6 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  29.1 
 
 		 462 aa  153  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  28.47 
 
 		 481 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  29.28 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  28.73 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  28.05 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  29.02 
 
 		 427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  32.75 
 
 		 417 aa  147  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  28.81 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  28.33 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  30.81 
 
 		 441 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  29.51 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  27.21 
 
 		 430 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  26.57 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  27.42 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  26.98 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  26.98 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.3  Na(+)/H(+) antiporter  98.25 
 
 		 60 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  27.02 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  24.28 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  26.94 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4285  hypothetical protein  82.61 
 
 		 49 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25.96 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.4 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.24 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  23.63 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  26.1 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  22.43 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  24.29 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.52 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.39 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  24.78 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.2  Na(+)/H(+) antiporter  82.05 
 
 		 46 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  23.13 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  24.79 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.27 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  27.14 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.04 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  23.53 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  24.09 
 
 		 577 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  25.16 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  25.16 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  25.16 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  25.16 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  25.78 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  26.29 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  30.9 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  24.38 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  26.44 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  22.6 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>