118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2676 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  100 
 
 		 450 aa  894    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  64.4 
 
 		 457 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  65.97 
 
 		 449 aa  570  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  65.68 
 
 		 462 aa  568  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  64.24 
 
 		 462 aa  559  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  64.39 
 
 		 452 aa  524  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  45.41 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  47.31 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  42.98 
 
 		 476 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  42.54 
 
 		 489 aa  362  9e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  42.79 
 
 		 478 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  42.09 
 
 		 489 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  42.32 
 
 		 489 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  45.31 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  42.41 
 
 		 491 aa  353  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  41.65 
 
 		 489 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  41.65 
 
 		 489 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  43.81 
 
 		 490 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  43.05 
 
 		 480 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  42.92 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  41.65 
 
 		 489 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  41.65 
 
 		 489 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  43.35 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  42.79 
 
 		 477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  44.26 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  43.74 
 
 		 432 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  42.99 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  41.81 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  42.16 
 
 		 492 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  43.74 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  42.31 
 
 		 475 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  41.45 
 
 		 488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  40.36 
 
 		 493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  39.14 
 
 		 481 aa  299  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  40.22 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  36.12 
 
 		 483 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  33.79 
 
 		 430 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  34.62 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  31.96 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  33.83 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  31.29 
 
 		 431 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  31.81 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  30.68 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  30.68 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  32.75 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  31.28 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  31.22 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  33.25 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  31 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  32.65 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  32.01 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  32.39 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  34.17 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  34.17 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  34.17 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  34.17 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  32.82 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  33.5 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  30.75 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  33.17 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  33.17 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  32.99 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  32.18 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  29.7 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  30.3 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  24.57 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.87 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.03 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  26.62 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  23.84 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  23.68 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  25.74 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  32.58 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  23.23 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  27.09 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  27.2 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  26.76 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.3 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  25.96 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  23.49 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  26.86 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  25.61 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  24.14 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  24.17 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  27.33 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  22.61 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  24.39 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.38 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  27.67 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  25.68 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  26.88 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  27.52 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  22.25 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  22.25 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  25.9 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  25.95 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  22.25 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  24.54 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>