102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0247 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  100 
 
 		 427 aa  850    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  46.74 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  47.61 
 
 		 427 aa  345  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  44.26 
 
 		 428 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  43.36 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  45.24 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  39.78 
 
 		 456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  42.14 
 
 		 431 aa  318  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  41.27 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  43.88 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  41.69 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  38.99 
 
 		 458 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  39.11 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  30 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  28.88 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  28.67 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  30.05 
 
 		 467 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  28.57 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  28.14 
 
 		 462 aa  143  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  28.77 
 
 		 432 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  28.61 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  27 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  28.07 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  26.87 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  27.44 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  27.29 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  26.33 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  26.33 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  26.33 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  30.05 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  25.4 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  25.35 
 
 		 491 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 		 489 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  24.94 
 
 		 489 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  26.81 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  25.9 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  25 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  25.12 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  25.12 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  26.34 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  26.46 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  23.95 
 
 		 489 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  25.12 
 
 		 478 aa  122  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  27.83 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  28.67 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  26.46 
 
 		 481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  27.63 
 
 		 414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  25.83 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  25.83 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  25.83 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  25.83 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  25.45 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  24.07 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  23.26 
 
 		 489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  27.15 
 
 		 492 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  25 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  25.58 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  25.17 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  27.79 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  26.29 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  23.11 
 
 		 493 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  25.55 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  24.77 
 
 		 477 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  23.13 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  24.58 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  29.7 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  21.92 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  27.69 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  30.15 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  26.18 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  24.83 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.3 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  23.97 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  26.09 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.45 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2708  hypothetical protein  28.2 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  26.22 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.71 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.94 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  25 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  29.61 
 
 		 194 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  24.46 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  24.58 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.07 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  25.08 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2426  hypothetical protein  39.05 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23  decreased coverage  0.0038773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3024  hypothetical protein  40.66 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.49 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  31.45 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  23.32 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  26.14 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  24.34 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  28.86 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  24.36 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  25.83 
 
 		 447 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25.97 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  22.7 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  25.4 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>