99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42116 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  100 
 
 		 417 aa  831    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  46.93 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  46.55 
 
 		 428 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  44.67 
 
 		 427 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  46.38 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  46.08 
 
 		 427 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  43.29 
 
 		 458 aa  342  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  44.06 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  47.51 
 
 		 427 aa  332  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  45.16 
 
 		 427 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  40.42 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  39.72 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  41.69 
 
 		 427 aa  292  9e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  30.71 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  31.28 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  33.08 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  30.65 
 
 		 462 aa  159  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  32.91 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  28.57 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  28.33 
 
 		 448 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  31.91 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  32.07 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  27.76 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  29.74 
 
 		 475 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  28.88 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  28.34 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  26.09 
 
 		 481 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  27.75 
 
 		 476 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  29.02 
 
 		 452 aa  138  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  30.75 
 
 		 475 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  28.54 
 
 		 489 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  27.96 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  27.96 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  28.3 
 
 		 489 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  28.98 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.93 
 
 		 488 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  27.86 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  28.3 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  28.3 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  27.73 
 
 		 489 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  29.88 
 
 		 477 aa  132  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  29.45 
 
 		 492 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  33.5 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  31.7 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  33.5 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  32.15 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  28.24 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  27.74 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  32.26 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  33.25 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  32.75 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  32.75 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  32.75 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  32.75 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  28.7 
 
 		 476 aa  126  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  32.66 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  31.11 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  30.15 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  29.83 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  32.28 
 
 		 417 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  30.13 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  29.15 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  25.6 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  25.14 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  26.68 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  27.69 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.9 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  30.68 
 
 		 194 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  27.41 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  23.42 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.27 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  31.9 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26.84 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.65 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.4 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  23.08 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  24.92 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.43 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  22.29 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  25.49 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.01 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  26.92 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  25.9 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  29.37 
 
 		 577 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  24.34 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  24.29 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.55 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  26.78 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  24.51 
 
 		 427 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  30.08 
 
 		 427 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  23.89 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.62 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  27.91 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  25.09 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  31.01 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.1 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  29.14 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>