126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3512 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  100 
 
 		 448 aa  904    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  76.82 
 
 		 467 aa  699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  66.37 
 
 		 480 aa  595  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  62.14 
 
 		 489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  64.49 
 
 		 488 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  61.92 
 
 		 489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  61.92 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  61.47 
 
 		 476 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  63.68 
 
 		 491 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  60.83 
 
 		 489 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  60.83 
 
 		 489 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  62.53 
 
 		 490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  60.83 
 
 		 489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  60.39 
 
 		 478 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  60.61 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  64.24 
 
 		 460 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  59.07 
 
 		 476 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  62.2 
 
 		 490 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  60.4 
 
 		 481 aa  534  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  61.05 
 
 		 492 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  60.48 
 
 		 475 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  57.55 
 
 		 475 aa  529  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  59.17 
 
 		 477 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  59.73 
 
 		 476 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  59.41 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  56.85 
 
 		 493 aa  501  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  57.89 
 
 		 432 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  57.67 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  65.17 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  49.23 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  47.42 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  46.77 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  45.6 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  45.35 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  45.41 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  48.08 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  31.37 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  32.06 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  30.6 
 
 		 415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  29.45 
 
 		 428 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  30.85 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  30.55 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  30.94 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  30.88 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  31.26 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  30.24 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  30.32 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  30.39 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  30.09 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  30.09 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  29.45 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  30.67 
 
 		 414 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  28.05 
 
 		 458 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  28.36 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  30.75 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  30.75 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  30.75 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  30.75 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  29.83 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  29.6 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  29.69 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  30.91 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  28.33 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  29.63 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  28.97 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  30.22 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  28.54 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  26.91 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.15 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  26.05 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  24.89 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.28 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.28 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  24.66 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  26.71 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.94 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  24.56 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  24.73 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  25.38 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  24.47 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  24.46 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.48 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  22.55 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  23.62 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  27.57 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  24.47 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  24.12 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.11 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  22.77 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  25.18 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  24.87 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  25 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  24.7 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  24.7 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  25 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  24.7 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  24.7 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  24.7 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  26.79 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>