126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0679 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  77.9 
 
 		 476 aa  759    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  77.68 
 
 		 489 aa  761    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  77.9 
 
 		 489 aa  764    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  77.9 
 
 		 489 aa  760    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  77.51 
 
 		 490 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  70.21 
 
 		 480 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  73.74 
 
 		 489 aa  745    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  82.11 
 
 		 491 aa  831    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  77.47 
 
 		 478 aa  754    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  74.14 
 
 		 489 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  66.88 
 
 		 476 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 492 aa  991    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  69.16 
 
 		 475 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  73.94 
 
 		 489 aa  751    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  74.14 
 
 		 489 aa  753    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  65.2 
 
 		 475 aa  632  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  67.88 
 
 		 477 aa  627  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  66.24 
 
 		 476 aa  618  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  61.05 
 
 		 448 aa  555  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  59.15 
 
 		 490 aa  552  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  62.25 
 
 		 460 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  60.08 
 
 		 488 aa  542  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  60.18 
 
 		 467 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  55.71 
 
 		 481 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  56.25 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  52.47 
 
 		 493 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  55.21 
 
 		 432 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  55.21 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  58.59 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  50 
 
 		 483 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  43.57 
 
 		 449 aa  353  5e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  42.98 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  42.16 
 
 		 450 aa  347  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  41.59 
 
 		 462 aa  340  4e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  43.66 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  40.53 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  31.16 
 
 		 415 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  28.48 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  29.38 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  30.59 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  30.68 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  31.93 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  29.21 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  29.77 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  30.07 
 
 		 428 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  29.81 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  29.79 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  29.79 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  29.79 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  29.79 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  28.54 
 
 		 414 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  29.79 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  29.41 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  30.75 
 
 		 417 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  29.29 
 
 		 429 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  29.56 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  29.56 
 
 		 436 aa  147  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  29.31 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  31.33 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  29.22 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  29.1 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  31.67 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  29.45 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  27.03 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  28.33 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  26.45 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  26.59 
 
 		 437 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  26 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  26 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  25.75 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  23.68 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.76 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.04 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  22.25 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.17 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  27.73 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  25.24 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.27 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  27.25 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  28.39 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.86 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  30 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  22.96 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  27.04 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25.34 
 
 		 428 aa  57  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  26.71 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  23.87 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  26.71 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  26.71 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  26.71 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  26.71 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  26.52 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  26.71 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  26.52 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  24.72 
 
 		 440 aa  53.9  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  26.38 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  32.23 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  32.23 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  32.23 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>