72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1700 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  100 
 
 		 483 aa  966    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  56.05 
 
 		 493 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  51.79 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  50.65 
 
 		 491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  51.11 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  51.78 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  49.23 
 
 		 448 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  52.11 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  49.69 
 
 		 489 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  48.65 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  48.86 
 
 		 489 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  48.86 
 
 		 489 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  50.67 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  49.48 
 
 		 489 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  48.65 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  48.49 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  50.11 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  48.85 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  49.66 
 
 		 475 aa  428  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  52 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  50.44 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  49.14 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  48 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  47.78 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  47.49 
 
 		 475 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  48.44 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  48.44 
 
 		 470 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  47.59 
 
 		 476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  48.56 
 
 		 488 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  50.27 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  36.24 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  36.5 
 
 		 457 aa  279  9e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  33.96 
 
 		 462 aa  262  8e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  36.12 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  35.16 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  34.91 
 
 		 452 aa  249  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  27.04 
 
 		 415 aa  134  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  27.76 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  26.71 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  28.93 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  26.67 
 
 		 415 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  26.51 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  25.62 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  25.23 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  26.52 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  27.19 
 
 		 401 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  26.33 
 
 		 415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  26.33 
 
 		 415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  26.33 
 
 		 415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  26.33 
 
 		 415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  26.27 
 
 		 436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  26.27 
 
 		 436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  26.56 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  25.06 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  26.71 
 
 		 427 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  26.81 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  25.89 
 
 		 417 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  24.31 
 
 		 414 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  25.36 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  24.6 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  26.79 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  24.4 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  28 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  24.34 
 
 		 429 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  25.79 
 
 		 431 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  24.55 
 
 		 427 aa  93.6  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  22.55 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.67 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  20.77 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  23.39 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  23.61 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  31.2 
 
 		 429 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>