157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0837 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  83.57 
 
 		 415 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  82.65 
 
 		 415 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  83.86 
 
 		 415 aa  668    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  82.89 
 
 		 415 aa  681    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  84.34 
 
 		 436 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  84.1 
 
 		 436 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  79.52 
 
 		 415 aa  653    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  84.58 
 
 		 436 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  100 
 
 		 415 aa  822    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  83.57 
 
 		 415 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  81.2 
 
 		 415 aa  660    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  83.57 
 
 		 415 aa  667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  84.1 
 
 		 415 aa  673    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  83.57 
 
 		 415 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  60.1 
 
 		 401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  55.42 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  56.19 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  78.87 
 
 		 194 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  32.27 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  30.35 
 
 		 480 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 489 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  32.47 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  30.37 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  32.78 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  30.02 
 
 		 489 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  30.23 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  29.79 
 
 		 489 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 476 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  32.84 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 		 452 aa  176  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  28.12 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  29.76 
 
 		 489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.11 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  29.86 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  29.76 
 
 		 489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  29.93 
 
 		 491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  29.52 
 
 		 489 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  33.59 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  30.24 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  30.91 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  29.25 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.61 
 
 		 488 aa  169  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  32.41 
 
 		 429 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  28.8 
 
 		 477 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  27.82 
 
 		 460 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  32.83 
 
 		 457 aa  162  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  28.94 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  29.51 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  29.59 
 
 		 462 aa  156  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  29.29 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  28.35 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  28.5 
 
 		 493 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  30.54 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  28.87 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  28.22 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  26.6 
 
 		 481 aa  146  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  29.21 
 
 		 427 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 427 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  27.76 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  29.34 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  28.84 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  27.17 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  24.66 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  27.46 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  27.84 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  26.71 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  26.7 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  27.3 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  29.03 
 
 		 425 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.3  Na(+)/H(+) antiporter  91.23 
 
 		 60 aa  90.5  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  26.65 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.68 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.87 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4285  hypothetical protein  71.74 
 
 		 49 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.94 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  25.42 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  25.21 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  24.04 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.37 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  24.62 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  23.4 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  22.58 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  24.93 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.92 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  26.15 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.16 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  20.77 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  23.04 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  24.22 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.2  Na(+)/H(+) antiporter  66.67 
 
 		 46 aa  59.7  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  25.71 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  23.01 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  26.67 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.69 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  25.37 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  22.44 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  27.62 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  23.17 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>