130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0111 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 460 aa  922    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  65.71 
 
 		 488 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  63.17 
 
 		 448 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  61.35 
 
 		 478 aa  548  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  61.57 
 
 		 489 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  61.15 
 
 		 480 aa  548  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  63.32 
 
 		 491 aa  548  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  63.78 
 
 		 467 aa  541  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  61.57 
 
 		 489 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  61.57 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  60.92 
 
 		 489 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  60.92 
 
 		 489 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  61.35 
 
 		 476 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  60.13 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  60.92 
 
 		 489 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  60.7 
 
 		 489 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  62.47 
 
 		 490 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  60.87 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  59.19 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  60.57 
 
 		 492 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  60.45 
 
 		 432 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  60.23 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  60.22 
 
 		 476 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  55.99 
 
 		 477 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  56.04 
 
 		 475 aa  501  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  58.07 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  55.51 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  53.93 
 
 		 493 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  59.46 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  47.81 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  45.54 
 
 		 449 aa  361  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  43.74 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  44.34 
 
 		 462 aa  344  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  44.92 
 
 		 452 aa  342  1e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  45.11 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  42.95 
 
 		 450 aa  336  5e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  29.61 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  29.75 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  29.98 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  30.12 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  28.64 
 
 		 428 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  29.66 
 
 		 431 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  30.23 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  29.6 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  28.98 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  28.89 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  27.1 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  29.38 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  29.12 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  29.17 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  28.57 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  28.88 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  26.96 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  28.44 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  30.22 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  27.56 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  27.56 
 
 		 436 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 		 427 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  27.56 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  27.45 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  27.45 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  27.45 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  27.45 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  27.79 
 
 		 415 aa  134  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  26.64 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  26.54 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.53 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.76 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  26.04 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  26.04 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.28 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  24.34 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  24.32 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  25.65 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  27.03 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  28.61 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.29 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  24.48 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  23.89 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25.68 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  24.03 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  24.11 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  28.67 
 
 		 194 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  25.99 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  22.63 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  24.18 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  22.77 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  24.49 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  22.01 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  24.24 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  26.56 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  27.13 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  24.2 
 
 		 577 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  26.75 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  25.95 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  21.84 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  27.13 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  21.1 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>