87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3442 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  100 
 
 		 465 aa  944    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  65.17 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  58.15 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  63.88 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  58.27 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  60.42 
 
 		 490 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  56 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  55.07 
 
 		 489 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  56.74 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  54.83 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  60.78 
 
 		 490 aa  441  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  57.77 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  57.77 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  54.11 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  55.85 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  57.77 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  57.77 
 
 		 489 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  56.99 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  58.31 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  59.31 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  58.59 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  58.56 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  59.46 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  59.67 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  52.99 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  53.97 
 
 		 475 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  56.16 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  52.02 
 
 		 432 aa  359  7e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  52.02 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  50.27 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  44.12 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  40.97 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  41.15 
 
 		 457 aa  266  8e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  42.9 
 
 		 452 aa  262  8e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  40.81 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  40.22 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  28.5 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  29.83 
 
 		 426 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  27.1 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  26.97 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  30.06 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  29.25 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  27.7 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  26.39 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  28.06 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  30.12 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  27.86 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  26.69 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  26.21 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  25.9 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  25.98 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  28.07 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  28.21 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  27.78 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  27.78 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  26.55 
 
 		 415 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  25.56 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  25.14 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  27.57 
 
 		 401 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  27.78 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  26.82 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  26.82 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  26.82 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  26.82 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  26.4 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  24.58 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  26.55 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25.74 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  22.55 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  25.15 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.66 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.14 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.14 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  23.08 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.55 
 
 		 421 aa  53.9  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  25.8 
 
 		 451 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  24.18 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  23.47 
 
 		 431 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  23.74 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  25.83 
 
 		 194 aa  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.26 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  23.92 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  25 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  26.2 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  28.65 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  26.27 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  25.27 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>