130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2753 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  79.1 
 
 		 476 aa  751    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  78.89 
 
 		 489 aa  751    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  79.1 
 
 		 489 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  78.68 
 
 		 489 aa  751    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 490 aa  984    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  74.19 
 
 		 480 aa  705    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  67.3 
 
 		 475 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  78.89 
 
 		 489 aa  745    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  78.63 
 
 		 491 aa  758    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  78.68 
 
 		 478 aa  746    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  79.1 
 
 		 489 aa  749    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  76.65 
 
 		 492 aa  721    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  78.89 
 
 		 489 aa  747    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  79.1 
 
 		 489 aa  749    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  66.1 
 
 		 476 aa  644    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  67.95 
 
 		 475 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  66.88 
 
 		 477 aa  624  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  66.1 
 
 		 476 aa  624  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  62.2 
 
 		 448 aa  571  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  62.92 
 
 		 460 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  60.34 
 
 		 490 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  60.97 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  61.95 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  59.83 
 
 		 481 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  58.44 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  54.77 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  58.88 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  53.33 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  53.33 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  51.3 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  44.44 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  43.61 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  43.54 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  42.13 
 
 		 462 aa  352  7e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  42.29 
 
 		 462 aa  350  2e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  43.19 
 
 		 452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  32.18 
 
 		 415 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  30.59 
 
 		 415 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  31.11 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  31.85 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  30.99 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  29.88 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  30.26 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  29.91 
 
 		 456 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  29.08 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  29.29 
 
 		 414 aa  159  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  32.18 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  30.99 
 
 		 415 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  29.37 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  31.4 
 
 		 427 aa  156  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  30.57 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  29.57 
 
 		 415 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  29.57 
 
 		 415 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  29.57 
 
 		 415 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  29.57 
 
 		 415 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  30.35 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  29.57 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  29.57 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  28.07 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  29.57 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  31.26 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  30.68 
 
 		 415 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  29.11 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  31.54 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  28.47 
 
 		 417 aa  139  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  27.21 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  26.53 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  26.89 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  26.89 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.33 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.59 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  27.1 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.64 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  26.47 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  27.27 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  25.37 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  26.85 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  24.88 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  26.28 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  25.32 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  25.32 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  25.32 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  25.32 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.43 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  27.92 
 
 		 194 aa  63.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  25.8 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.89 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  26.46 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  25 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  24.73 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  25.64 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25.94 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  25.64 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.74 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  25.43 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  27.59 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26.47 
 
 		 465 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  23.87 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  23.76 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>