135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1848 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  100 
 
 		 429 aa  858    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  64.32 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  51.28 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  51.17 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  48.58 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  50.94 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  48.85 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  51.65 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  52.91 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  47.19 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  46.93 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  42.2 
 
 		 441 aa  350  4e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  41.27 
 
 		 427 aa  298  2e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  31.81 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  29.98 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  30.43 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  31.06 
 
 		 452 aa  169  9e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  30.54 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  30.43 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  30.41 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  30.93 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  30.09 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  30.56 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  32.07 
 
 		 489 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  31.85 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  31.85 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  31.63 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  29.75 
 
 		 460 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  31.63 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  31.4 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  31.4 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  31.4 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  28.88 
 
 		 476 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  31.18 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  30.46 
 
 		 491 aa  155  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  30.85 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  29.6 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  29.11 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  28.19 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  28.07 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  28.09 
 
 		 488 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  30.52 
 
 		 415 aa  146  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  30.45 
 
 		 414 aa  146  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  31.05 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  27.63 
 
 		 475 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  29.05 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  32.06 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  32.69 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  30.79 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  27.49 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  30.1 
 
 		 401 aa  136  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  30.31 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  30.55 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  29.69 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  29.62 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  29.62 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  29.62 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  29.62 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  30.47 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  30.49 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  28.95 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  26.39 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  25.25 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  27.7 
 
 		 465 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  23.78 
 
 		 483 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  28.12 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  27.17 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  26.32 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  24.47 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.94 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  25.75 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  26.34 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  26.74 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  26.72 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  26.67 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  26.06 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  25.07 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  24.94 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  30.89 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  26.2 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  24.93 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  25.82 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  26.74 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  23.15 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  26.74 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  26.52 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  24.88 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  22.92 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.07 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  33.88 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  26.84 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3024  hypothetical protein  44.74 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  25.3 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  26.52 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  26.52 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  26.52 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  26.52 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.11 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  25.99 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>