120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0699 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  78.86 
 
 		 476 aa  766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  77.39 
 
 		 489 aa  774    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  77.6 
 
 		 489 aa  776    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  77.8 
 
 		 489 aa  774    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  78.87 
 
 		 490 aa  706    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  71.25 
 
 		 480 aa  698    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  78.86 
 
 		 489 aa  759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 491 aa  992    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  78.01 
 
 		 478 aa  757    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  79.28 
 
 		 489 aa  766    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  82.11 
 
 		 492 aa  803    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  67.72 
 
 		 475 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  79.07 
 
 		 489 aa  765    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  67.52 
 
 		 476 aa  643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  79.28 
 
 		 489 aa  766    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  69.04 
 
 		 475 aa  630  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  66.88 
 
 		 476 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  66.38 
 
 		 477 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  63.68 
 
 		 448 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  59.15 
 
 		 490 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  63.56 
 
 		 467 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  63.76 
 
 		 460 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  61.06 
 
 		 488 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  56.98 
 
 		 481 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  58.48 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  54.45 
 
 		 493 aa  498  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  54.77 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  54.55 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  56 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  51.78 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  44.52 
 
 		 457 aa  362  1e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  42.46 
 
 		 462 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  42.86 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  42.41 
 
 		 450 aa  353  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  44.6 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  40.31 
 
 		 462 aa  333  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  30.24 
 
 		 426 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  29.11 
 
 		 414 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  28.25 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  29.02 
 
 		 441 aa  160  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  27.35 
 
 		 456 aa  159  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  30.73 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  29.62 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  30.02 
 
 		 415 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  30.46 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  31.13 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  30.26 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  29.74 
 
 		 415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  30.59 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  30.59 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  30.59 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  30.59 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  31.52 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  30.4 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  30.5 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  30.93 
 
 		 401 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  30.61 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  30.35 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  28.63 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  28.91 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  30.12 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  30.49 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  29.88 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  29.67 
 
 		 415 aa  144  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  27.86 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  27.96 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  24.94 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.29 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.74 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  24.01 
 
 		 428 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.75 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.84 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  24.49 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  24.49 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  24.37 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  25.73 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.33 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  28.77 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  24.87 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.59 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  23.42 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  24.79 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  24.05 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  23.31 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.66 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  24.38 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  22.35 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  24.33 
 
 		 422 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  22.12 
 
 		 441 aa  53.9  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  23.93 
 
 		 441 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  23.01 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  23.01 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  23.01 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  23.02 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  24.95 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  25.97 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  22.8 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  23.01 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  22.8 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  26.02 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>