124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0500 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 452 aa  903    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  66.81 
 
 		 462 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  68.34 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  66.59 
 
 		 449 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  63 
 
 		 457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  62.53 
 
 		 450 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  46.85 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  46.24 
 
 		 467 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  45.95 
 
 		 490 aa  363  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  44.64 
 
 		 476 aa  358  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  43.3 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  42.86 
 
 		 489 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  42.63 
 
 		 489 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  42.51 
 
 		 476 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  43.64 
 
 		 491 aa  350  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  42.13 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  44.11 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  43.93 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  44.22 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  42.6 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  42.6 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  42.6 
 
 		 489 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  42.6 
 
 		 489 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  44.18 
 
 		 476 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  43.75 
 
 		 488 aa  338  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  44.58 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  42.47 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  44.58 
 
 		 432 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  43.51 
 
 		 475 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  42.67 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  41.39 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  41.81 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  40.09 
 
 		 481 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  40.61 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  41.64 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  34.32 
 
 		 483 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  34.87 
 
 		 430 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  31.57 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  32.74 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  32.11 
 
 		 428 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  33.09 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  34.06 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  30.94 
 
 		 429 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  33.33 
 
 		 415 aa  173  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  30.7 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  32.99 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  32.51 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  34.68 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  31.46 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  33.03 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  32.94 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  33.25 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  31.51 
 
 		 436 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  31.51 
 
 		 436 aa  163  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  31.81 
 
 		 436 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  31.77 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  31.78 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  31.78 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  31.78 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  31.78 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  32.2 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  31.46 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  29.01 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  31.75 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  29.67 
 
 		 417 aa  147  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  28.53 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.78 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  28.01 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  23.98 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  24.21 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  28.38 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  24.88 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  27.83 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  30.46 
 
 		 194 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  27.33 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  25.82 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.47 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  24.41 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  24.66 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  26.75 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  26.75 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  25.49 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.33 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  25.28 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  23.19 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  28.43 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  23.65 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  23.65 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  27.78 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  28.9 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  28.9 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  28.9 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  28.9 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  23.13 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  25.53 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.29 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  24.15 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  28.43 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>