126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3272 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  77.23 
 
 		 476 aa  749    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  68.47 
 
 		 476 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  69.33 
 
 		 489 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  69.33 
 
 		 489 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  69.33 
 
 		 489 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  66.6 
 
 		 475 aa  634    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  66.53 
 
 		 489 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  67.72 
 
 		 491 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  67.45 
 
 		 478 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  75.21 
 
 		 477 aa  716    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  66.53 
 
 		 489 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  76.81 
 
 		 476 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  100 
 
 		 475 aa  961    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  66.32 
 
 		 489 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  66.53 
 
 		 489 aa  639    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  69.16 
 
 		 492 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  69.56 
 
 		 490 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  64.64 
 
 		 480 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  60.48 
 
 		 448 aa  551  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  61.07 
 
 		 460 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  57.95 
 
 		 490 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  59.56 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  60.56 
 
 		 488 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  54.04 
 
 		 481 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  53.9 
 
 		 470 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  50.31 
 
 		 493 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  54 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  55.85 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  54 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  48.14 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  42.61 
 
 		 457 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  42.31 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  42.43 
 
 		 449 aa  340  4e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  41.34 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  41.02 
 
 		 462 aa  325  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  41.55 
 
 		 452 aa  319  9e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  30.75 
 
 		 456 aa  173  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  29.91 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  29.62 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  31.03 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  29.31 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  29.11 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  29.48 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  29.3 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  27.52 
 
 		 431 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  28.38 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  28.26 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  27.4 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  28.15 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  28.67 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  28.5 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  28.67 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  28.39 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  30.75 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  28.67 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  28.21 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  28.21 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  28.21 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  28.21 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  28.73 
 
 		 427 aa  143  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  28.44 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  29.47 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  27.95 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  29.15 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  23.13 
 
 		 427 aa  93.6  7e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  26.44 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  27.03 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.36 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.34 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  23.74 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  23.74 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.16 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25.45 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  23.96 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  23.42 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  24.89 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  26.32 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  30.32 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.4 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  29.48 
 
 		 194 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  21.75 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  24.29 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.31 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  22.93 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  24.73 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  23.72 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  22.94 
 
 		 427 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  25.43 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  23.76 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  22.35 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  22.35 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  25.19 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  22.35 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  23.45 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  22.35 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  23.32 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  22.47 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  22.56 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>