111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06635 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 456 aa  909    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  55.51 
 
 		 441 aa  481  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  44.74 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  47.3 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  47.19 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  45.32 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  45.23 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  44.69 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  44.57 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  45.85 
 
 		 427 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  43.42 
 
 		 427 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  40.42 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  39.78 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  30.74 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  30.69 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  31.21 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  30.72 
 
 		 449 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  31.4 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  30.3 
 
 		 476 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  31.45 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  31.59 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  29.21 
 
 		 460 aa  167  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.85 
 
 		 467 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  30.75 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  30.57 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  29.66 
 
 		 478 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  28.78 
 
 		 475 aa  163  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  30.34 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  32.23 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  29.86 
 
 		 490 aa  159  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  27.35 
 
 		 491 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  28.76 
 
 		 489 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  29.6 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  29.65 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  28.31 
 
 		 476 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  28.31 
 
 		 489 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  28.09 
 
 		 489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  28.09 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  28.09 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  28.09 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  29.24 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  28.09 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.09 
 
 		 488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  29.77 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  28.51 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  27.59 
 
 		 493 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  31.92 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  28.7 
 
 		 417 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  26.97 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  25 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  27.95 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  28.03 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  28.47 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  28.04 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  27.42 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  27.64 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  29.18 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  29.18 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  29.18 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  29.18 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  27.42 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  29.11 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  29.29 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  26.81 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  24.6 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  26.79 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  29.58 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  24.41 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.47 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.68 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.88 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  21.32 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.06 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  29.3 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  23.75 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.88 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  37.08 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.35 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  24.13 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.59 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  37.5 
 
 		 194 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3024  hypothetical protein  39.13 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  23.95 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  26.15 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  23.27 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  24.33 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  24.29 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2426  hypothetical protein  36.05 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23  decreased coverage  0.0038773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  23.26 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  23.26 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  24.27 
 
 		 427 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  23.1 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  23.91 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  22 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  24.73 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  24 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  24.94 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  25.97 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2708  hypothetical protein  37.35 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>