18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4285 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4285  hypothetical protein  100 
 
 		 49 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  84 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  84 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  84 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  76.6 
 
 		 415 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  84.78 
 
 		 415 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  82.61 
 
 		 415 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  82.61 
 
 		 415 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  82.61 
 
 		 415 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  82.61 
 
 		 415 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  76.6 
 
 		 415 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  78.72 
 
 		 415 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  80.43 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  78.26 
 
 		 415 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  69.39 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  55.1 
 
 		 401 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  54.17 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  58.97 
 
 		 414 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>