More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1596 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1596  shikimate kinase  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0865399  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1629  shikimate kinase  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.682402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  56.49 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  34.97 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  35.33 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  38.98 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  37.93 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  38.26 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  39.66 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  38.14 
 
 		 206 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  40.62 
 
 		 184 aa  97.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  29.59 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  35.34 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  31.55 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  42.48 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  36.31 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0696  shikimate kinase  36.36 
 
 		 163 aa  95.1  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  36.94 
 
 		 170 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  35.66 
 
 		 190 aa  94.4  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  36.31 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  36.31 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  35.04 
 
 		 208 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  36.36 
 
 		 186 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  33.83 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1039  Shikimate kinase  34.06 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0118821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  33.11 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7573  shikimate kinase  35.06 
 
 		 237 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3143  shikimate kinase II  30.2 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 593 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3282  shikimate kinase II  30.2 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  33.08 
 
 		 196 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  31.82 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  30.54 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  42.11 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  36.48 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  36.48 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3293  shikimate kinase II  29.53 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.431512  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  35.67 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  34.97 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  40.82 
 
 		 185 aa  91.3  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  32.39 
 
 		 192 aa  91.3  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  36.31 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  31.71 
 
 		 174 aa  90.9  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  32.72 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  34.57 
 
 		 165 aa  90.9  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  38.33 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  32.7 
 
 		 170 aa  90.9  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  35.65 
 
 		 178 aa  90.9  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  36.88 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3313  shikimate kinase II  27.56 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2273  shikimate kinase  29.59 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0270  Shikimate kinase  41.46 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000287272  normal  0.701055 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  41.35 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2022  shikimate kinase  36.11 
 
 		 192 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0997  shikimate kinase II  26.92 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.287041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  34.78 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  34.48 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  38.3 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  33.33 
 
 		 201 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  31.08 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  41.74 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  32.58 
 
 		 200 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  35.29 
 
 		 206 aa  88.6  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  41.74 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  35 
 
 		 191 aa  88.2  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  38.94 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  25.86 
 
 		 216 aa  88.2  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  27.49 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  35.65 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1381  Shikimate kinase  33.06 
 
 		 188 aa  87.8  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  30.64 
 
 		 200 aa  87.8  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  40.3 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  36.54 
 
 		 224 aa  87.8  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  31.15 
 
 		 193 aa  87.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  36.88 
 
 		 180 aa  87.8  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  30.64 
 
 		 217 aa  87.4  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3110  shikimate kinase  31.52 
 
 		 174 aa  87.4  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  31.15 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  40 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  31.76 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  27.38 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  34.19 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  34.19 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2880  shikimate kinase  37.23 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  39.82 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2010  Shikimate kinase  29.01 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2486  shikimate kinase  33.04 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0460027  normal  0.0259491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  36.13 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  27.54 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  33.05 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  32.17 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  35.76 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  32.62 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  36.36 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  34.75 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  33.75 
 
 		 196 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  33.99 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  31.58 
 
 		 177 aa  85.5  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  32.74 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  36.88 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>