More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2486 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2486  shikimate kinase  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0460027  normal  0.0259491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  57.22 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  61.74 
 
 		 193 aa  187  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  62.76 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  62.07 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  54.24 
 
 		 196 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  51.19 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  46.93 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  50.6 
 
 		 604 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  50.6 
 
 		 579 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  50.6 
 
 		 579 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  47.4 
 
 		 591 aa  154  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  44.79 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  46.39 
 
 		 593 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0679  shikimate kinase  46.37 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  45.25 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  48.34 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  46.84 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  40.91 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  53.24 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  43.37 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  40.91 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  51.08 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  47.09 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  45.62 
 
 		 192 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  43.11 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  47.89 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  42.33 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 594 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  48.2 
 
 		 206 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  50.7 
 
 		 552 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  47.77 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  44 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7573  shikimate kinase  47.65 
 
 		 237 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  50.34 
 
 		 615 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  46.48 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  45.45 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  43.43 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  43.17 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  45.78 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  42.94 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  42.35 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  42.35 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  45.52 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  42.35 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  42.35 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  42.35 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  42.35 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  42.35 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  42.86 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  42.86 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  45.65 
 
 		 229 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  48.55 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  46.9 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  42.01 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0395  shikimate kinase  48.1 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  44.2 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  37.2 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  39.18 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  38.82 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  39.2 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  38.2 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  39.39 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  45.65 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  39.39 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  44.93 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  44.93 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  42.18 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  39.39 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  39.72 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  38.79 
 
 		 171 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  38.92 
 
 		 171 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  38.79 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  38.79 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  38.79 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  38.18 
 
 		 171 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  43.8 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  38.79 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  38.75 
 
 		 163 aa  111  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  38.79 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  38.79 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  38.79 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  38.79 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  38.62 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  41.29 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  38.18 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  38.41 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  43.24 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  35.71 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  42.03 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  38.27 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  38.18 
 
 		 171 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  41.38 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  43.17 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  39.39 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  44.68 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  44.68 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  37.58 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3248  shikimate kinase  42.03 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  38.46 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>