More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2351 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  53.77 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  51.37 
 
 		 301 aa  254  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  50.68 
 
 		 301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 298 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 298 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  51.75 
 
 		 319 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 342 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  51.4 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  39.16 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  41.22 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 316 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.23 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 319 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 300 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 289 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  36.07 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  35.36 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 313 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  34.29 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  38.83 
 
 		 290 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  43.55 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>