More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0971 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  55.18 
 
 		 308 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 307 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  51.99 
 
 		 301 aa  275  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  47.73 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  48.84 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  52.86 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 296 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  52.19 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 296 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  48.55 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  51.38 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  46.67 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  53.54 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.83 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 342 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  47.19 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  50.33 
 
 		 302 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  47.33 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  47.49 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 294 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  43.92 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  47.93 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  45.7 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  41.41 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  47.93 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  43.52 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 296 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0847  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 319 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  41.22 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 296 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.32 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  39.26 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  39.13 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  39.07 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1852  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0644  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 289 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>