More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1345 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  83.85 
 
 		 296 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  80.2 
 
 		 296 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  65.54 
 
 		 302 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  65.08 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  64.07 
 
 		 301 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  62.5 
 
 		 302 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  63.14 
 
 		 302 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  57.39 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 298 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  51.19 
 
 		 301 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 		 299 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 302 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 298 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 298 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 299 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 313 aa  255  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 342 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 319 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  45.27 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 307 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 319 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  44.3 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3225  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2938  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0644  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  41.46 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  39.93 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3332  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0789426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0847  LysR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 289 aa  195  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  39.24 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.04 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  36.24 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>