More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4490 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  100 
 
 		 301 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  96.35 
 
 		 301 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  85.38 
 
 		 302 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  73.49 
 
 		 302 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  64.43 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  64.07 
 
 		 296 aa  364  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  62.08 
 
 		 296 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 302 aa  321  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 298 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 		 298 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 298 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  56.66 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 310 aa  308  9e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 298 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 301 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 317 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 300 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.83 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 316 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  49.15 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  48.17 
 
 		 302 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 299 aa  281  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 307 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  47.64 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 298 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 303 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  46.49 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  52.26 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 322 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 296 aa  248  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  49.13 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 308 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  44.26 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  52.96 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  46.44 
 
 		 308 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  43.92 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  41.95 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  42.12 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  42.14 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11490  Transcriptional regulator, LysR family  43.79 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0644  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.01 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 294 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 294 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 304 aa  201  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  37.33 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4540  transcriptional regulator, LysR family  46.82 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>