More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1187 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  600  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  57.05 
 
 		 304 aa  339  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 303 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  53.18 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  53.18 
 
 		 299 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  48.01 
 
 		 301 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  46.78 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  46 
 
 		 300 aa  265  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  51.99 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  46.41 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 305 aa  241  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  46.78 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 317 aa  221  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  44.78 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.07 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  43.06 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  41.83 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  42.11 
 
 		 310 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 296 aa  201  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  38.78 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4311  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  36.77 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  43.06 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.52 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 340 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1852  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>