More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6433 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  603  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 303 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 301 aa  348  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  56.77 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  57.05 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 309 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  45.03 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 308 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 302 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 299 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 302 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.28 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  45.27 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  40.46 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  43.92 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  44.97 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 317 aa  225  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  44.86 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  43.92 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 319 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.14 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  38.44 
 
 		 290 aa  211  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.52 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1852  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  43.19 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  40.67 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 289 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  40.48 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  37.83 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 		 319 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>