More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0801 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  610  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 296 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0644  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 298 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  34.01 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 297 aa  198  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.95 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3530  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 296 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  31.03 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  34.59 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5252  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2459  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157929  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1783  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.294417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1852  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  35.15 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.25 
 
 		 299 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1619  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 303 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal  0.542444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4560  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  33.92 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  35.09 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>