More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4728 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  78.6 
 
 		 300 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  68.46 
 
 		 298 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  56.27 
 
 		 299 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 		 299 aa  348  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 298 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 298 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 298 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  53.18 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 296 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  53.18 
 
 		 301 aa  294  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  52.84 
 
 		 302 aa  292  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 308 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  53.85 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  53.51 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 299 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 310 aa  271  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 301 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.75 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 312 aa  258  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  44.82 
 
 		 299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 320 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  41.14 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  44.15 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 308 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  46.55 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  42.81 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  42.14 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3225  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  43.01 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.13 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 300 aa  205  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  37.98 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0644  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 324 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 334 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 324 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 324 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>