More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1521 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  63.51 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 301 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  63.18 
 
 		 299 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 303 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  55.03 
 
 		 304 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 301 aa  309  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 300 aa  288  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  48.98 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 300 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 299 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  48.46 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 309 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  46.33 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  45.7 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  47.97 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 342 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  47.12 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  46.53 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  46.69 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  47.37 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.25 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.73 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  46.34 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.76 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0847  LysR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  41.81 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  41.1 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  41.38 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 300 aa  195  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  40.53 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1852  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.98 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>