More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4682 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  83.85 
 
 		 296 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  81.08 
 
 		 296 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  65.77 
 
 		 301 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  63.76 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  64.43 
 
 		 301 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  63.09 
 
 		 302 aa  349  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  56.01 
 
 		 301 aa  328  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 298 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 298 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  51.19 
 
 		 301 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 298 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 309 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  49.31 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  47.39 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  45.27 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 315 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  47.74 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 319 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  40.8 
 
 		 310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  41.47 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3225  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 317 aa  208  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  40.89 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  40.42 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.04 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2938  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 304 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  38.03 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0644  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  38.68 
 
 		 293 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>