More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4867 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  79.67 
 
 		 308 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  78.9 
 
 		 308 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 307 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  66.78 
 
 		 315 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  62.17 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  59.39 
 
 		 317 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  57.57 
 
 		 310 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0847  LysR family transcriptional regulator  55.76 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  47.3 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  47.97 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  46.64 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  46.62 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.86 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  46 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  45.08 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  42.38 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 322 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  43.43 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  42.67 
 
 		 319 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  46.39 
 
 		 319 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  39.33 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 303 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.73 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  32.99 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  36.25 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  32.99 
 
 		 289 aa  168  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 289 aa  168  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  35.64 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1373  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0934  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0359  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0637  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>