More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0046 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  81.57 
 
 		 217 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  81.5 
 
 		 200 aa  325  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  71.09 
 
 		 217 aa  287  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  72.04 
 
 		 217 aa  287  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  47.96 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  47.12 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  45.54 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  46.04 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  48 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  48 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  48 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  44.71 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  43.66 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  44.13 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  43.33 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  43.66 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  43.66 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  42.86 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  43.19 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  43.19 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  42.92 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  42.92 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  41.2 
 
 		 220 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  41 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  41 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  41 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  42.33 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  42.33 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  42.33 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  42.33 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  42.33 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  41.5 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  42.93 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  41.83 
 
 		 311 aa  164  8e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  41.09 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  38.83 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  38.83 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  38 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  36.18 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  36.68 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  36.68 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  36.68 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  36.68 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  36.68 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  36.68 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  42.71 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  44.17 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  38.97 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  42.33 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  43.14 
 
 		 326 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  38.97 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  38.97 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  43.6 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  46.8 
 
 		 276 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  38.97 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  36.82 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  36.82 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  36.82 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  36.82 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  36.82 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  36.82 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  35.27 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  41.67 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  41.79 
 
 		 250 aa  148  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  41.18 
 
 		 250 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  41.43 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  40.49 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  42.06 
 
 		 258 aa  148  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  41.55 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0626  flagellar biosynthesis protein FliP  42.56 
 
 		 256 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  40.67 
 
 		 251 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  39.71 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  40.67 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  41.29 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0239  flagellar biosynthesis protein FliP  42.05 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.197588  normal  0.0281676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  40.67 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0706  flagellar biosynthesis protein FliP  42.05 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  39.09 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  40.38 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  40.19 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  38.76 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  40 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  40.91 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  39.09 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  40.29 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  43.5 
 
 		 255 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  40.09 
 
 		 262 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  44.22 
 
 		 238 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  37.5 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  38.73 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  37.98 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  37.5 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  41.26 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1634  flagellar biosynthetic protein FliP  42.5 
 
 		 337 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.296967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  40.8 
 
 		 289 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  41.26 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  40.67 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>