More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0110 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  100 
 
 		 220 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  47.42 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  44.86 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  44.86 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  45.69 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  41.74 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  44.66 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  41.67 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  41.67 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  41.67 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  41.67 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  42.4 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  42.4 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  45.23 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  45.23 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  45.23 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  43.13 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  38.97 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  38.97 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  42.11 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  38.97 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  40.87 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  41.63 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  40.29 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  40.29 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  41.63 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  41.63 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  42.03 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  40.1 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  39.61 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  38.79 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  38.79 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  38.79 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  38.79 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  38.79 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  38.79 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  39.81 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  41.29 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  41.29 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  41.29 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  41.29 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  41.29 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  39.91 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  39.91 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  39.91 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  39.91 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  39.91 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  39.91 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  39.19 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  39.9 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  40.2 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  41 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  41.5 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  40.2 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  41.71 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  41.29 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  42.5 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  36.41 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  35.43 
 
 		 311 aa  143  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3080  surface presentation of antigens protein SpaP  41.94 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.833245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  37.44 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3043  surface presentation of antigens protein SpaP  41.94 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3095  surface presentation of antigens protein SpaP  41.94 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3012  surface presentation of antigens protein SpaP  41.94 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3200  surface presentation of antigens protein SpaP  41.94 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  41.71 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  39.61 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  40.48 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  40.48 
 
 		 253 aa  141  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  40.48 
 
 		 283 aa  141  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 255 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  39.53 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  39.9 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  42.58 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  39.53 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  38.81 
 
 		 289 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  41.83 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  39.27 
 
 		 289 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  39.44 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  39.07 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  36.45 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  36.45 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  41.58 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  40.49 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  41.95 
 
 		 287 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  37.39 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  42.44 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  39.71 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  43.56 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  43.75 
 
 		 264 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  38.12 
 
 		 256 aa  138  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  39.41 
 
 		 252 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  39.23 
 
 		 251 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  40.89 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  41.15 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  39.71 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  39.8 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  43.56 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  39.91 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>